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来源:DeepTech深科技
“这项研究能直接用于提升 T 细胞疗法和 CAR-T 细胞疗法的功效。具体来说,我们搭建了一款细胞骨架模型,能用于研究细胞骨架力学性质对于其他种类细胞的影响,进而能为细胞疗法的发展或揭示相关机理带来促进作用,以及为药物研发提供指导。”哈佛大学博士生刘禹彤表示。
日前,她和所在团队发现当 CAR-T 细胞被暴露在弹性更高的细胞骨架之中,杀死肿瘤细胞的能力会更强,对于小鼠肿瘤的控制力度也更大。
对于肿瘤我们并不陌生,其内部是一个非常复杂的微环境。在肿瘤逐渐变大的过程中,肿瘤会持续向外释放各种细胞信号因子,以便达到改造环境、促进血管生成、诱导免疫耐受的目的。
同时,它也会合成大量的胶原蛋白并向周围释放,同时也会释放大量的赖氨酰氧化酶,以便和细胞骨架发生交联。
期间,肿瘤的生物力学特性会发生较大的变化,硬度和弹性都会慢慢增高。
此前,肿瘤的生物力学特性已经被证实会影响肿瘤细胞的生长和侵袭能力。学界也曾提议将这种生物力学特性作为癌症诊断和癌症预后的指标。
那么,由肿瘤发展所导致的生物力学特性的改变,到底会对免疫细胞产生哪些影响?对于这一问题的答案,至今尚无人知。
基于上述背景,刘禹彤等人开展了本次研究。其表示:“当时,这次论文的共同一作 Kwasi 发现当把 T 细胞放在不同浓度的胶原蛋白里,它们的表型会出现不同。对于这个发现我们都很感兴趣,觉得可能是细胞骨架本身就能对 T 细胞造成影响。”
与此同时,他们也意识到并不能单纯地使用胶原蛋白。原因在于无法在未经修改的胶原蛋白骨架上分离硬度和粘弹性。因为这两个参数是互相关联的,往往其中一个改变,另一个也会随之改变,这样无法获悉所观测的结果到底来自哪个参数的变化。
因此,她和 Kwasi 设计并验证了一个基于胶原蛋白的系统,该系统可以单独地控制硬度和黏弹性。
分析学界已有的肿瘤单细胞测序结果之后他们发现,来自肿瘤、健康组织、以及血管里的 T 细胞的基因表达有着很大不同。基于此,他们猜测此次所观察到的基因表达变化,有一部分可能是肿瘤力学特性所导致的。
如前所述,肿瘤在发展过程中其硬度和黏弹性会同时改变,这时要想进行分离变量,使用体内临床组织或动物模型根本行不通,所以只能自行设计体外细胞骨架模型。
于是,他们设计了一个基于 I 型胶原蛋白的体外细胞骨架模型。具体设计过程如下:先让 I 类胶原蛋白自行交联,在形成胶原纤维之后,通过扩散的方式加入小分子交联剂,并运用点击化学的方式,在已经成型的胶原蛋白凝胶中再次进行局部交联。
这样一来,就可以在不改变胶原蛋白凝胶硬度的情况下,通过改变小分子交联剂的浓度来改变凝胶的弹性,从而分别研究两个变量对于 T 细胞的影响。运用这个模型,该团队发现当 T 细胞被暴露在更具弹性的环境之中,它们的表型和基因表达,都偏向更容易被激活的作用型 T 细胞。
而当 T 细胞被暴露在更具黏性的环境之中时,它们更偏向于成为记忆型 T 细胞。同时,相比黏性更好的细胞骨架,弹性更好的细胞骨架更容易给细胞留下印记,并且这种印记是长期的。
随后,他们发现细胞骨架的力学特性,是通过一个名为 AP-1 的转录因子作用于 T 细胞的。
同时,这种细胞骨架的生物力学特性,对于 T 细胞的影响不仅存在于实体肿瘤,也存在于各种常见的纤维化疾病例如特发性肺纤维化病之中。原因在于,纤维化疾病一般伴有大量胶原蛋白的合成和交联,这一点和实体肿瘤也很相似。
接着,针对细胞骨架力学特性对于 T 细胞功能的影响,课题组也进行了研究。期间,他们把 CAR-T 细胞放在拥有不同力学特性的细胞骨架中,将其提取出来之后,再来观察它们对于肿瘤细胞的杀伤能力。
(来源:Nature Biomedical Engineering)就这项研究的意义来说:
其一,目前针对细胞和分子生物学的研究,大多使用体外细胞培养和小鼠模型的方式。但是,体外细胞培养的环境和体内实际环境相差太大,很难具备生理学意义。
而小鼠模型和临床模型往往存在太多变量。尤其在研究细胞骨架的时候,根本无法区分所观察到的变化到底来自于哪一个变量。
通过构建一个体外的细胞骨架模型,就可以在人体各个组织的力学参数范围内,来研究某一特定的变量对于细胞表型和细胞功能的改变。
其二,大部分关于细胞骨架的生物力学特性的研究,都是针对类似于肿瘤细胞这种粘着细胞。针对免疫细胞的研究很少,因为免疫细胞大多是悬浮细胞,其存在于血管中,很少和细胞骨架接触。
但是,要想让免疫细胞在患处产生作用,就必须浸润到组织之中,这时组织的力学特性就会对它们产生影响。
而该团队首次在特异性免疫细胞中,将多种力学参数分离开,进而来研究这些参数对于免疫细胞的影响。
其三,近年来人们发现 CAR-T 细胞疗法的抗癌功效和 CAR-T 的表型非常相关。不同表型的 CAR-T 细胞抗癌功效差异很大。
(来源:Nature Biomedical Engineering)接下来,他们会继续使用基于一类胶原蛋白的细胞骨架模型去研究其他问题,包括研究更加细分的 T 细胞,以及研究其他类型的免疫细胞和成纤维细胞。
据介绍,刘禹彤来自辽宁沈阳。高中毕业之后,她前往美国加州大学伯克利分校读本科,主修生物工程、辅修化学专业。
大二时,她开始正式接触科研。当时,她加入了加州大学伯克利分校伊琳娜·康博伊(Irina Conboy)教授的实验室。Irina 是衰老领域的先锋人物,也是第一个用异时联体共生(将一个“老老鼠”和“小老鼠”连在一起)进行衰老研究的学者。
在 Irina 实验室里,刘禹彤主要研究不同的小分子药物对于衰老和组织修复的影响,并探索将这些药物用于恢复组织再生能力的可行性。
大二暑假,在美国驻瑞士大使馆的 ThinkSwiss program 的资助之下,她前往瑞士洛桑联邦理工大学进行暑期科研,期间主要研究衰老方向的端粒融合。
大三暑假,刘禹彤参加美国冷泉港实验室的暑期科研项目,期间开始接触前列腺癌相关的研究。
其表示:“后来我在 2017 年末从 UC Berkeley 以最高荣誉毕业。2018 年,我前往哈佛大学攻读博士学位,我的论文课题主要关注于 CAR-T 细胞的生产,即通过改变现有的 CAR-T 生产流程,来让 CAR-T 对肿瘤尤其是对实体肿瘤能够更加有效。”
(来源:Nature Biomedical Engineering)目前,科研圈男女比例依然失衡,面对科研有些女生不免心生恐惧。对此,刘禹彤表示:“一是要告诉自己并不比别人差,目前没有任何研究表明女生在数理化和科研上没有男生学得好,我周围从事科研的女性学者都很聪明、很专注、很有想法,因此要相信别人能做到的我也可以。二是要找到能给自己提供支持和指导的 support system,遇到困难时有人能提供情感/学术上的帮助非常重要。三是如果真的是自己想尝试的事情,那就一定要拼尽全力,就算没有如愿至少也不后悔。”
参考资料:1.Adu-Berchie, K., Liu, Y., Zhang, D.K.Y.et al. Generation of functionally distinct T-cell populations by altering the viscoelasticity of their extracellular matrix. Nat. Biomed. Eng (2023). https://doi.org/10.1038/s41551-023-01052-y
运营/排版:罗以
好了,关于科学家搭建体外细胞骨架模型,证实力学信号对于T细胞的影响,将为CAR-T药物研发提供指导就讲到这。
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