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来源:DeepTech深科技
课题组开创了研究衰老的一个全新角度,借此发明一种抗衰老新方法。通过使用合成生物学的方法,在对控制衰老的基因调控网络进行重新编程之后,该团队合成了一个基因震荡器,让细胞寿命延长了 82%。
图 | 郝楠(来源:郝楠)此次研究要从该团队三年前同样发表在 Science 上的论文说起。那时,他们发现同样的细胞在同样的环境下会有两种不同的衰老途径:一半细胞的 DNA 在衰老过程中会变得不稳定以至于死亡,另一半细胞则会因线粒体失去功能而死亡。
接着,课题组发现这两条衰老途径由抗衰老因子 Sir2 和 HAP 控制:Sir2 可以维持 DNA 稳定,HAP 可以维持线粒体功能。
这两个因子通过相互抑制,可以形成一个互抑网络。这个互抑网络就像开关一样,控制着细胞衰老和死亡的途径。当 Sir2 处于高位,HAP 处于低位时,细胞线粒体功能下降,从而导致衰老;当 Sir2 处于低位,HAP 处于高位时,细胞 DNA 会变得不稳定,从而导致衰老。
在 Sir2-HAP 互抑网络的影响之下,细胞必然会通过两条衰老通路中的其中一条发生老化和死亡。
而在本次 Science 论文中,该团队想到这样一个办法:如能把 Sir2 和 HAP 的互相抑制关系,重新编程成 HAP 激活 Sir2、Sir2 抑制 HAP 的负反馈网络,就有可能形成一个震荡网络,从而让 Sir2 和 HAP 的表达量出现周期性变化。
即可以实现一会儿是 Sir2 高、HAP 低,一会儿是 Sir2 低、HAP 高。这样一来,细胞就会在两条衰老通路之间来回转化,但却不会选择其中任何一条,从而极大延缓了细胞损伤的积累,进而显著延长细胞的寿命。
(来源:Science)根据这一想法,课题组对基因网络进行重新编程。具体来说,他们利用数学模型模拟了几种可能实现震荡网路重编程的方法,并找出一种效果最好、可行性最高的方法来做实验。
实验中,他们同时尝试了几个不同的调控组件,最终合成了此次论文中的基因震荡器。和电脑模拟的结果一样,其在实验中证实重编程的基因网路的确能让 Sir2 的表达量在细胞衰老中保持震荡。
多个对照组实验结果显明,上述震荡可以延缓细胞损伤的积累和细胞的衰老,并能让细胞寿命增加了 82%,这也是该团队迄今为止发现的活得最长的细胞,甚至比用传统基因筛选方法选出的长寿变异细胞活得都要更长。
基于这一成果可以实现更有效的基于基因或细胞的抗衰老疗法,比如改造或者重编程人类干细胞中的基因调控网路,借此延缓衰老过程和老年病的发生发展。
郝楠补充称:“需要着重突出的是我们定量合成生物学的思路和方法,即用数学建模和计算机模拟,可以帮助我们更好地理解生物学的过程和原理,并能辅助我们设计构建新的生物网路,来实现对于生物功能的改造。”
目前,将工程学的思路和方法用于衰老研究仍是一个全新的方向,整体上还处于尝试阶段。而此次工作为该方向提供了一个成功案例,希望能够吸引激发更多人投入到这种跨学科探索中。
“我相信在不久的将来可以从根本上改变生物学的研究方法,极大推动我们对于衰老和其他生命现象的理解。下一步,我们希望能把同样的方法推广到其他抗衰老因子上,并且应用到哺乳动物和人类的细胞上。”郝楠表示。
另外,从细胞衰老的角度来讲,在长期压力之下细胞的损伤会被快速积累,进而加速衰老和老年病的发生。有意思的是,在生命早期的一些短暂的压力,反而能够提前激活细胞的应激机制,从而让细胞更好地应对生命过程中的后续压力,进而起到延长寿命的作用。
参考资料:
1.Zhou, Z., Liu, Y., Feng, Y., Klepin, S., Tsimring, L. S., Pillus, L., ... & Hao, N. (2023). Engineering longevity—design of a synthetic gene oscillator to slow cellular aging.Science, 380(6643), 376-381.
排版:朵克斯
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