英国BioBank将AWS托管数据分析平台与DNANEXUS进行速度研究

2022-06-19 19:46:11来源:

英国Biobank已获得资金来在亚马逊Web服务(AWS)云中建立一个数据分析平台,以至于它希望使世界各地的研究人员更容易访问它持有的健康数据。

自2006年以来,英国Biobank是长期研究,重点是建立遗传学和环境因素如何为人类疾病的发作有助于,其见解由来自超过500,000名英国志愿者收集的健康数据。

在未来五年内,该项目估计其数据库中存储的数据量将增长到15pb,这可能使得访问依赖它的研究人员更加困难。

“目前提供的数据批准用于下载的研究人员,这需要大量昂贵的本地存储空间以及计算能力,”英国BioBank表示在一个声明中。

反过来,这限制了可以将信息用于那些能够在本地存储和处理非常大量数据的人的那些研究人员的范围,这就是为什么基于云的替代品正在开发的原因。

英国Biobank的主要调查员Rory Collins表示,整个倡议的成功依赖于使组织能够以尽可能广泛的一系列研究团队获得的数据。

“这个新的平台将民主化进入,帮助我们释放世界上最好的科学思想的想象 - 无论他们都在何处 - 让发现改善人类健康,”他说。

该项目的资金正在通过药物专注的研究慈善机构提供,而平台本身正在通过AWS和美国数据分析和管理平台提供商DNAnexus的合作开发。

除了提供项目的托管和计算部分,AWS还承诺为批准早期职业研究人员提供1.5亿美元,以促进高中和中等收入国家的人员,以扩大英国的贡献者范围biobank。

一旦平台完成,这些研究人员就可以分析他们所需的数据,他们在云托管平台内,英国Biobank索赔将开放对它的访问,但也使其更快,更具成本效益。

“英国Biobank的平台原则上不仅使得更多的研究人员可以更能获得数据,而且 - 由于AWS的非凡慷慨 - 它将在实践中更加易于访问,”英国Biobank副首席执行官Mark Effingham博士说。

“在资源贫乏的环境和新科学家工作的研究人员的免费计算是在研究职业生涯中,是一种令人兴奋的方式来增加英国Biobank的惊人资源。”

在撰写本文时,希望该平台将为2021年夏季使用,并准备好研究人员,其开发和测试在整个2020年举行,并进入明年上半年。

Dnanexus的首席执行官Richard Daly表示,它与英国BioBank的工作是最新的一系列研究项目,即其技术近年来已被用于支撑在一起。

“在过去的11年里,Dnanexus支持全球研究人员的佩斯科学目标,通过简化复杂的数据分析,临床数据管理和规模洞察力来加速数字转型,”达利说。

“我们热情地支持基础英国Biobank项目,因为它通过与基因组学和先进的工具集成了深深的医疗数据来打破了疾病研究进步的新地面。”


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