“细菌”填补领域内又一空白,科学家发现细菌中存在泛素系统

2023-03-19 21:05:17来源:DeepTech深科技

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多年来,加州大学圣地亚哥分校细胞与分子医学系教授凯文·D·科贝特(Kevin D. Corbett)教授课题组,主要研究真核生物 Horma 和 Trip13,这些蛋白在有丝分裂、减数分裂和 DNA 修复中起着重要作用。2015 年,有论文称细菌中也有这些蛋白组分,这引起了他的注意。为此,他和课题组于 2016 年开启了相关研究。

在此之前,该团队的叶巧真博士曾解析了线虫和人类的 Trip13 的结构。她说:“这让我成为这项研究的主力之一,后来我解析了包括 CD-NTase/Horma/Trip13 复合体结构在内的多个蛋白的晶体结构,并于 2020 年在 Molecular Cell 上以背靠背的形式发表了两篇论文。这一途径后被称为 Type III CBASS。”

图 | 从左到右:叶巧真、凯文·D·科贝特(Kevin D. Corbett)。摄于 2021 年 7 月,恰逢 Kevin 在加州大学圣地亚哥分校建组 10 周年(来源:资料图)

科罗拉多大学博尔德分校生物化学系汉娜·莱德维娜(Hannah E. Ledvina)博士、以及叶巧真博士是共同一作,加州大学圣地亚哥分校细胞与分子医学系教授凯文·D·科贝特(Kevin D. Corbett)教授、美国科罗拉多大学博尔德分校生物化学系助理教授亚伦·怀特利(Aaron T. Whiteley)担任共同通讯作者。

据了解,在该论文中最重要的数据便是高质量的 Cap2/CD-NTase 复合物的结构。针对 CBASS 系统,这些新颖的数据提供了关于重要蛋白的相互作用和功能的分子细节。

在该工作里,关于噬菌体感染的研究上,课题组也给出了令人信服的酶学结论,为通过噬菌体治疗该类细菌所导致疾病提供了可靠依据。

据了解,细菌免疫是近年来兴起的学科领域, 相关研究成果大大开阔了人们的视野:

第一,这让人们可以向细菌取经:CRISPR-Cas 是细菌免疫的一个途径,通过研究人们发现了基因组编辑工具,该技术目前已广泛用于基础生物学研究、生物技术产品的开发和疾病治疗,相关学者已于 2020 年获得了诺贝尔化学奖。

第二,可以帮助人们找出进化的印迹:Type II (long) CBASS 中的 E1 和 E2 及 Type III CBASS 中的 Horma 和 Trip13,都是首先在真核生物中发现,对细菌中的这些蛋白进行研究,能让学界更深入地了解其进化机理。

第三,噬菌体有望用于细菌病的治疗:CBASS 细菌免疫途径最终的结果是被感染的细菌与噬菌体同归于尽,而且噬菌体只侵染细菌,这为人类细菌病的治疗提供了可靠的依据。

据了解,在本次研究中通过质谱分析,他们还发现 CD-NTase 可以结合多种非特异靶目标,但其特异的靶目标尚未得到确定,因此课题组会继续跟踪研究。

同时,生物信息学分析表明,类泛素系统在细菌中广泛存在。未来,他们也会继续探索该系统的作用机理。

参考资料:

1.Ledvina, H.E., Ye, Q., Gu, Y.et al. An E1–E2 fusion protein primes antiviral immune signalling in bacteria. Nature (2023). https://doi.org/10.1038/s41586-022-05647-4

排版:朵克斯

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